Actualmente compite Segunda División Nacional (Fútbol Sala), segunda categoría de este deporte en España. Participó dos temporadas en la División de Honor (Primera División). Tras el descenso el conjunto antequerano se mantiene tres temporadas en Tercera División volviendo a descender a Primera División Andaluza tras acabar 19º en la temporada 2011-12. Sería una ausencia efímera ya que los verdiblancos se alzarían con el título de la categoría retornando como Campeón a categoría nacional apenas 12 meses después de abandonarla. C.D. Antequerano. Del mismo modo el escudo mantendría grandes similitudes. En la temporada 2007-08 el equipo verdiblanco firma una grandísima temporada, dirigido desde el banquillo por José Carlos Fernández «Tello», acabando como subcampeón del grupo IX de Tercera División tras el CD Roquetas y con derecho a jugar la promoción de ascenso a Segunda B. En primera ronda eliminó al Narón BP con resultado de 0-0 y 4-1. En segunda ronda eliminó al Caravaca CF y ascendió a Segunda División B veintisiete años después de que lo hiciera el CD Antequerano. El equipo continuaría en Tercera División hasta la nefasta temporada 2003-04 en la que finalizó colista descendiendo a Primera División Andaluza donde permanecería dos temporadas, regresando al Grupo IX de Tercera tras quedar subcampeón de grupo tras el Vélez CF en 2006. En la temporada del retorno el equipo del Maulí finalizó 8º. En la temporada 2016-17 obtuvo un magnífico 2º puesto tras el Atlético Malagueño, consiguiendo así un puesto en la Copa del Rey para la próxima temporada, y así fue el 30 de agosto de 2017 jugó la primera ronda de la Copa del Rey 2017-18 en su campo «El Maulí» ganando 2-0 al Arcos C. F. y pasando a la siguiente ronda que se jugaría unos días después en Talavera de la Reina cayendo derrotado ante el club de esta ciudad por un 3-1 y finalizándose así su etapa en esa edición de la Copa del Rey.
2004-05 3.º clasificado de Primera División Andaluza, Grupo III. Tras su fundación y en su primera temporada el club consigue el ascenso a Tercera División de España tras finalizar 2º en la Regional Preferente de Málaga 1992-93. Tras un titubeante debut en categoría nacional, salvando por los pelos el descenso, la temporada siguiente 1994-95 será la mejor clasificación antequerana hasta el ascenso a 2ª División B del año 2008 acabando la liga en 6ª posición. En la recién terminada temporada 2018-19 ha firmado una excelente actuación, terminando en 3ª posición y clasificándose por tercera vez consecutiva para los playoffs de ascenso, aunque sin lograrlo. El club ofreció a Valverde la renovación de contrato por una temporada más con opción a una segunda por la mejora del juego y resultados del equipo, pero el entrenador prefirió esperar a finalizar la temporada para tomar una decisión. A partir de la temporada 1990-91, la Federación renovó el campeonato para establecer un modelo de liga regular y play-off por el título entre los cuatro mejor clasificados, de forma similar a otras ligas asiáticas. 2023-24 : – clasificado de Primera Federación.